{"count":2329,"next":"https://api-test.medunigraz.at/v1/research/project/?format=json&limit=20&offset=2000&ordering=-end_effective","previous":"https://api-test.medunigraz.at/v1/research/project/?format=json&limit=20&offset=1960&ordering=-end_effective","results":[{"id":1551,"title":{"de":"GENINCA - Genomic instability and genomic alterations in pre-cancerous lesions and/or cancer","en":"GENINCA - Genomic instability and genomic alterations in pre-cancerous lesions and/or cancer"},"short":"GENINCA","url":null,"abstract":{"de":"GENINCA will address two tumor entities, for which we have good access to pre-malignant lesions and in which genomic instability is a common feature: colorectal and liver cancer. \r\nGENINCA represents a collaborative study of 8 academic and 3 industrial partners from 5 European countries. GENINCA will focus on exploring pre-cancerous and cancer lesions of the two aforementioned tumor entities and their respective microenvironment. As the recent identification of human colon-cancer initiating cells by one of our academic consortium members paves the way for completely new strategies for studying mechanisms of tumorgenesis, a particular focus of this grant proposal will be the detailed characterization of these cancer initiating stem cells. At present, it is still a matter of debate which genomic changes are already present in precursor lesions and whether these lesions already show genetic instability. We will therefore address the occurrence of genomic instability and explore their underlying mechanisms especially in pre-cancerous and early cancer lesions. This will be greatly facilitated by in vivo endomicroscopy approaches, sophisticated animal models and large-scale genomic and proteomic analyses. Furthermore, we ill include an in-depth analysis of the corresponding microenvironment. As this represents a translational research effort, we expect to identify markers for novel therapeutic and/or preventative strategies, as well as facilitating tumor diagnosis, prognosis, and monitoring.","en":"GENINCA will address two tumor entities, for which we have good access to pre-malignant lesions and in which genomic instability is a common feature: colorectal and liver cancer. \r\nGENINCA represents a collaborative study of 8 academic and 3 industrial partners from 5 European countries. GENINCA will focus on exploring pre-cancerous and cancer lesions of the two aforementioned tumor entities and their respective microenvironment. As the recent identification of human colon-cancer initiating cells by one of our academic consortium members paves the way for completely new strategies for studying mechanisms of tumorgenesis, a particular focus of this grant proposal will be the detailed characterization of these cancer initiating stem cells. At present, it is still a matter of debate which genomic changes are already present in precursor lesions and whether these lesions already show genetic instability. We will therefore address the occurrence of genomic instability and explore their underlying mechanisms especially in pre-cancerous and early cancer lesions. This will be greatly facilitated by in vivo endomicroscopy approaches, sophisticated animal models and large-scale genomic and proteomic analyses. Furthermore, we ill include an in-depth analysis of the corresponding microenvironment. 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Da solcherart neuoplastische Effekte mit einer erhöhten kortikospinalen Erregbarkeit einhergehen, eignen sich hier nichtinvasive Methoden wie TMS und fMRI für den Nachweis. Im Rahmen dieses Projekts sollen zwei Arten der afferenten Stimulation zur Anwendung kommen, die periphere Magnetstimulation und die biomechanische Stimulation. Bezüglich der Stimulationsfrequenz gibt es Hinweise dass eine Frequenz um 25 Hz optimal sein könnte (kortikale Resonanz), daher sollen hier 10 und 25 Hz getestet werden. Ziel des Projekts ist es die Post-Stimulus-Effekte bezüglich ihrer Effektstärke und Anhaltedauer zu charakterisieren und hinblicklich ihrer zugrunde liegenden Mechanismen (unmasking, LTP) zu diskutieren. Ein weiters Ziel ist es die Ergebnisse für die Neurorehabilitation nutzbar zu machen.","en":"The proposed research examines the hypothesis that sustained somatosensory stimulation induces post-stimulus adaptive changes in primary motor cortex of healthy subjects. As such changes are associated with increased corticospinal excitability and reorganization of cortical networks, non-invasive assessment tools like transcranial magnetic stimulation (TMS) and functional magnetic resonance imaging (fMRI) are suited to evaluate the stimulation effects. Two types of sensory stimulation will be tested and compared here, repetitive peripheral magnetic stimulation (RPMS) of hand muscles and whole-hand mechanical stimulation (MSTIM). The research strategy employs a series of experiments to quantify the adaptive changes following stimulation protocols with different parameters. Specifically, we are interested into stimuli to effectively modulate the motor cortex, and into the reliability of the two assessment tools to quantify the post-stimulus effects. These experimental series will provide a fundamental scientific basis for better understanding how sustained sensory stimulation modulates central motor controlling structures and will help to evaluate the potential clinical benefit from the proposed stimulation techiques."},"begin_planned":"2009-01-01T01:00:00+01:00","begin_effective":"2009-01-01T01:00:00+01:00","end_planned":"2010-12-31T01:00:00+01:00","end_effective":"2011-06-30T02:00:00+02:00","assignment":"2008-12-22T11:08:25+01:00","program":79,"subprogram":null,"organization":14010,"category":10,"type":10,"partner_function":4,"manager":51814,"contact":51814,"status":2,"research":1,"grant":10,"event":null,"study":null,"language":null,"funders":[12],"funder_projectcode":null,"ethics_committee":null,"edudract_number":null,"persons":["1706-51814-10"]},{"id":1436,"title":{"de":"Chromosomale Instabilität bei Alterung und Krebs","en":"Chromosomal instability in aging and cancer"},"short":"CHROMOS_INSTAB_AGING_CANCER_2007","url":null,"abstract":{"de":"This project aims at elucidating factors involved in CIN and age-dependent aneuploidy. We want to address the hypothesis whether CIN or aneuploidy is caused by specific genetic alterations in a single gene or whether it is the consequence of mutations in several or a large number of genes. The project consists of three different steps: In a first, mainly descriptive step, we will employ latest 3D-multicolor FISH imaging techniques directly on tissue sections or on single cell suspensions to identify CIN/aneuploid regions in real biological material. In a second step, we will apply to these CIN/aneuploid regions our unbiased whole genome amplification strategies for subsequent array-CGH. This strategy will yield a high-resolution analysis of the genome of the respective areas or of individual cells. Regions within the tumor genome, which are commonly gained or lost will pinpoint locations of genes, which may be involved in the occurrence of CIN and aneuploidy. Candidate genes identified by this approach will be sequenced. The third, functional step, involves RNAi for gene knockdown of selected genes to verify that their reduced function has indeed an impact on chromosomal stability. Thus, this project combines both descriptive in vivo and functional in vitro technologies to derive significant biological conclusions.\r\n","en":"This project aims at elucidating factors involved in CIN and age-dependent aneuploidy. We want to address the hypothesis whether CIN or aneuploidy is caused by specific genetic alterations in a single gene or whether it is the consequence of mutations in several or a large number of genes. The project consists of three different steps: In a first, mainly descriptive step, we will employ latest 3D-multicolor FISH imaging techniques directly on tissue sections or on single cell suspensions to identify CIN/aneuploid regions in real biological material. 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For the first time, it is turned into a potential opportunity. The new concept of analysis of just one single molecule in solution over extended periods of time will make it possible to observe the single molecules without bias to the millisecond range in solution of freely diffusing molecules or to artificial immobilization on surfaces or hydrodynamic focusing. The following main idea is put forward: is it possible to statistically recognize the same molecule multiple times as it diffuses through a small confocal probe volume? If so, the detection time of an individual molecule freely diffusing in solution could be extended. For the new analysis approach, it is crucial to understand the balance between the time scale and the frequency that a single molecule reenters the confocal probe volume and the overall time necessary for the measurement. \r\nThe proposed research will provide with a better understanding of some of the theoretical and experimental backgrounds of these types of analyses and biological or medical applications. The originality and innovative nature of the proposal work reside in the strict coupling of latest microscopic and spectroscopic developments with physiological relevance. The new ideas are comprehensively presented and this relationship is a new concept at the time. Possible users for this concept are those working in biotechnological applications dealing with gene technology. Furthermore, the concept is of interest for a great number of medical, pharmaceutical and bio-chemical laboratories. It may serve as a foundation for further work in single-cell biology and immunology.\r\n\r\nURL: http://topics.scirus.com/Measurements_of_Single_Molecules_in_Solution_and_Live_Cell_at_Time_Scales_That_Are_Currently_Not_Available_Impact_on_Immunology.html","en":"FWF Austrian Science Fund Project P20454-N13: Stand-Alone Collaborative Research Project with visiting professorships (Forschungsprofessuren) in the USA, Japan and Cairo for about 27 months: dienstzuteilung aboard (im Ausland). \r\n\r\nThe work presented in this authorized and supported project program involves the development of a new analysis technique for single-molecule spectroscopy and imaging. For the first time, it is turned into a potential opportunity. 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In dieser Zeit treten auch die für das Rett-Syndrom charakteristischen Handstereotypien auf. Mit Phase 3 tritt eine relative Stabilisierung des Entwicklungsstandes ein; Phase 4 ist gekennzeichnet von erneuten motorischen und kognitiven Beeinträchtigungen. Da eine Diagnose meist erst im Vorschul- oder Schulalter erfolgt, gibt es wenig systematisches Wissen über die Prä-Regressionsphase. \r\nZiel des eingereichten Projekts ist die Erstellung spezifischer Entwicklungsprofile dieser ersten Phase und zwar in Abhängigkeit von Locus und Typ (missense/nonsense) der Mutation. Unsere detaillierten Analysen der Frühzeichen sowie der Genotyp-Phänotyp Beziehungen und des prä-diagnostischen Verlaufs basieren auch auf Audio- und Videoaufnahmen, die uns von betroffenen Patienten und deren Familien weltweit zur Verfügung gestellt werden. Diese internationalen Kooperationen stellen uns vor das Problem technisch unterschiedlicher Aufnahmesysteme. Ein Video-Konverter würde unsere Arbeit erheblich erleichtern und den Datenverlust minimieren. Damit könnten wir letzlich unserem längerfristigen Ziel der besseren Versorgung betroffener Mädchen und ihrer Familien durch das verlässliche Identifizieren von Frühzeichen einen Schritt näher kommen.","en":"Rett Syndrom, eine schwerwiegende neurologische Erkrankung, durch de novo-Mutationen des MECP2 Gens verursacht, hat einen vierphasigen Verlauf: Nach einem mehr oder weiniger unauffälligen ersten Lebensjahr (Phase 1) kommt es zur Regression (Phase 2), in der erworbene Fähigkeiten wie Sprache und motorische Funktionen wieder verloren gehen. In dieser Zeit treten auch die für das Rett-Syndrom charakteristischen Handstereotypien auf. Mit Phase 3 tritt eine relative Stabilisierung des Entwicklungsstandes ein; Phase 4 ist gekennzeichnet von erneuten motorischen und kognitiven Beeinträchtigungen. 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Aufbauend auf langjähriger Erfahrung in elektronenmikroskopischen Forschungsprojekten wird dieses Mikroskop die 3D-Untersuchung feinster Strukturen im Inneren von Zellen und Geweben und die genaue Lokalisation chemischer Elemente mit hoher Auflösung ermöglichen und so völlig neue Forschungsbereiche für die biomedizinischen Forschung in Graz eröffnen. Ein Kipphalter, ein Energiefilter, ein Röntgenemissionsdetektor und spezielle Software werden neue, unverzichtbare Technologien, Elektronentomographie und Analytische Elektronenmikroskopie, und damit eine Reihe neuer, innovativer Forschungsprojekte ermöglichen. \r\nDie Elektronentomographie dient zur Visualisierung feinster Strukturen im 3D - Bereich. Mittels Kipphalter werden dafür Präparate unter unterschiedlichen Blickwinkeln untersucht und spezielle bildverarbeitende Verfahren ermöglichen daraufhin eine 3D-Rekonstruktion. \r\nMit der Analytischen Elektronenmikroskopie kann man die chemischen Elemente in einem Schnittpräparat identifizieren und deren Verteilung in hoher Auflösung darstellen. Dieses Verfahren beruht darauf, dass jedes chemische Element auf eine charakteristische Weise mit dem Elektronenstrahl interagiert. Mittels Detektion dieser elementtypischen Interaktionen (Elektronenenergieverlustspektroskopie, EELS, und Energiedispersive Röntgenspektroskopie, EDX) können die chemischen Elemente innerhalb der Probe identifiziert werden. Mittels Energiefilter-Transmissionselektronenmikroskopie, EFTEM, kann die Verteilung der chemischen Elemente im Präparat dargestellt werden.\r\n\r\nBeispiele für Anwendungen dieser neuen Technologien sind im 3D-Bereich die Entstehung von Fetttröpfchen in Zellen oder die Gestalt und das Zusammenspiel von Molekülen, die an der synaptischen Übertragung an Kontaktstellen im Nervensystem beteiligt sind; Beispiele für Forschungsprojekte in der Analyse chemischer Elemente sind die Aufnahme und der Transport von Nanopartikeln im Körper (Teilbereich der Nanotechnologie), die Detektion medizinisch relevanter Einlagerungen von Schwermetallen in Geweben oder die Diagnostik neuroendokriner Erkrankungen.\r\n\r\n","en":"An der Medizinischen Universität Graz wird ein neues Hochleistungs-Transmissionselektronenmikroskop beantragt. 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Mittels Kipphalter werden dafür Präparate unter unterschiedlichen Blickwinkeln untersucht und spezielle bildverarbeitende Verfahren ermöglichen daraufhin eine 3D-Rekonstruktion. \r\nMit der Analytischen Elektronenmikroskopie kann man die chemischen Elemente in einem Schnittpräparat identifizieren und deren Verteilung in hoher Auflösung darstellen. Dieses Verfahren beruht darauf, dass jedes chemische Element auf eine charakteristische Weise mit dem Elektronenstrahl interagiert. Mittels Detektion dieser elementtypischen Interaktionen (Elektronenenergieverlustspektroskopie, EELS, und Energiedispersive Röntgenspektroskopie, EDX) können die chemischen Elemente innerhalb der Probe identifiziert werden. Mittels Energiefilter-Transmissionselektronenmikroskopie, EFTEM, kann die Verteilung der chemischen Elemente im Präparat dargestellt werden.\r\n\r\nBeispiele für Anwendungen dieser neuen Technologien sind im 3D-Bereich die Entstehung von Fetttröpfchen in Zellen oder die Gestalt und das Zusammenspiel von Molekülen, die an der synaptischen Übertragung an Kontaktstellen im Nervensystem beteiligt sind; Beispiele für Forschungsprojekte in der Analyse chemischer Elemente sind die Aufnahme und der Transport von Nanopartikeln im Körper (Teilbereich der Nanotechnologie), die Detektion medizinisch relevanter Einlagerungen von Schwermetallen in Geweben oder die Diagnostik neuroendokriner Erkrankungen.\r\n\r\n"},"begin_planned":"2009-06-10T02:00:00+02:00","begin_effective":"2009-06-10T02:00:00+02:00","end_planned":"2011-05-31T02:00:00+02:00","end_effective":"2011-05-31T02:00:00+02:00","assignment":null,"program":null,"subprogram":null,"organization":25164,"category":10,"type":10,"partner_function":4,"manager":50960,"contact":50960,"status":2,"research":1,"grant":10,"event":null,"study":null,"language":null,"funders":[10,135],"funder_projectcode":null,"ethics_committee":null,"edudract_number":null,"persons":["2797-50960-10"]},{"id":1260,"title":{"de":"SFB: Mathematische Optimierung mit Anwendungen in der biomedizinischen Forschung\r\n1. Förderperiode","en":"SFB: Mathematical Optimization with Applications in Biomedical Sciences"},"short":"Mathematical Optimization","url":"http://math.uni-graz.at/mobis/","abstract":{"de":"In this project, a realistic computer model of the heart, a “Virtual Heart” simulator will be developed to investigate mechanisms underlying the formation of arrhythmias, the most frequent cause of death in the industrialized world, and their termination by electrical shocks (electrical defibrillation). During the first phase, research will focus on different aspects of defibrillation with the goal to optimize the procedure to allow safe termination of arrhythmias with a fraction of energy requirements of current devices. For the first time, defibrillation will be formulated as an optimization problem using optimal control techniques to devise novel shock strategies. Further, techniques for the generation of microscopically accurate cardiac tissue models will be developed by applying novel strategies for segmentation and multi-modal registration  allowing the fusion of image stacks obtained with different imaging modalities (histological sections and MRI). To deal with the computational burden imposed by the resulting large systems (5-50 Mio dof), parallel algebraic MG and BEM/FEM coupling techniques will be applied to render parameters studies involving whole heart bidomain simulations including a torso possible.\r\nLong term goals include advanced techniques to optimize the exploration of complex parameter spaces associated with defibrillation with OPTIM, inverse methods will be considered to compute cardiac surface potentials from electrical or optical  recordings, and we will incorporate a mechanical contraction model and a fluid mechanical model to investigate electromechanical coupling and mechano-electrical feedback mechanisms and to link modelling results to clinically relevant quantities.","en":"In this project, a realistic computer model of the heart, a “Virtual Heart” simulator will be developed to investigate mechanisms underlying the formation of arrhythmias, the most frequent cause of death in the industrialized world, and their termination by electrical shocks (electrical defibrillation). 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Diese Prognose ist ungünstiger als die der systolischen Herzinsuffizienz (SHI) und ebenfalls als die vieler Krebserkrankungen. Die Sterberate der DHI bleibt erschreckend hoch ohne sichtbare Verbesserung in den letzten 20 Jahren. Eine der wichtigsten Ursachen für das Fehlen einer effektiven Therapie ist das mangelnde Verständnis der zugrunde liegenden Mechanismen dieser Erkrankung. Im Gegensatz zur SHI, liegen nahezu keine Daten diesbezüglich für die DHI vor.\r\nZiel dieses Projektes ist es daher, ein geeignetes Tiermodell für die DHI quantitativ zu evaluieren, um anschließend die zellulären Mechanismen, die der DHI zugrunde liegen, aufzuklären. Basierend auf den Erkenntnissen dieses Projektes können neue Strategien für die Verbesserung der Diagnose und Behandlung der diastolischen Herzinsuffizienz aufgebaut werden.","en":"Herzinsuffizienz (Herzmuskelschwäche) ist mit einer deutlichen Einschränkung der Lebensqualität und einer hohen Sterblichkeitsrate verbunden und stellt eine der größten gesundheitlichen und ökonomischen Belastungen der Gesellschaft in Europa dar.\r\nDie diastolische Herzinsuffizienz (DHI) hat eine sehr schlechte Prognose: rund die Hälfte der Patienten verstirbt innerhalb von 5 Jahren nach Diagnosestellung. Diese Prognose ist ungünstiger als die der systolischen Herzinsuffizienz (SHI) und ebenfalls als die vieler Krebserkrankungen. Die Sterberate der DHI bleibt erschreckend hoch ohne sichtbare Verbesserung in den letzten 20 Jahren. Eine der wichtigsten Ursachen für das Fehlen einer effektiven Therapie ist das mangelnde Verständnis der zugrunde liegenden Mechanismen dieser Erkrankung. 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Unter Lipotoxizität versteht man die fehlgesteuerte Aufnahme bzw. Produktion von Fettsäuren und Lipiden, die zur Bildung (lipo)toxischer Substanzen führen, die Dysfunktion von Zellen und Geweben bewirken und im Zelltod enden können. Wir wollen jene metabolischen Vorgänge und molekularen Mechanismen untersuchen, die durch lipotoxische Effektoren ausgelöst werden und die pathologische Basis prävalenter Erkrankungen, wie z.B. dem Metabolischen Syndrom, Typ-2 Diabetes und Atherosklerose darstellen. Dieses hochgesteckte Ziel ist nur durch eine gemeinsame Anstrengung innerhalb eines dynamischen und interaktiven Konsortiums, die weit über die Möglichkeiten innerhalb von Einzelprojektförderungen  hinausgeht, zu erreichen. Durch Einsatz aktueller genomischer, proteomischer und lipidomischer Methoden sollen neue lipotoxische Stoffwechselwege entdeckt werden. Durch Einsatz mutanter Maus- und Hefemodelle werden jene molekulare Mechanismen untersucht, durch die zelluläre Dysfunktion und Zelltod bewirkt werden. Die gewonnenen Erkenntnisse können somit einen wichtigen Beitrag zur Auffindung neuartiger Diagnose- und Behandlungsmethoden leisten.","en":"Das Ziel des SFB-LIPOTOX ist die Zusammenführung relevanter Forschungsgruppen um gemeinsam ein zentrales Thema zu bearbeiten, Lipotoxizität. Unter Lipotoxizität versteht man die fehlgesteuerte Aufnahme bzw. Produktion von Fettsäuren und Lipiden, die zur Bildung (lipo)toxischer Substanzen führen, die Dysfunktion von Zellen und Geweben bewirken und im Zelltod enden können. Wir wollen jene metabolischen Vorgänge und molekularen Mechanismen untersuchen, die durch lipotoxische Effektoren ausgelöst werden und die pathologische Basis prävalenter Erkrankungen, wie z.B. dem Metabolischen Syndrom, Typ-2 Diabetes und Atherosklerose darstellen. 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Others and our group have recently produced considerable evidence that PGD2 might be involved in the initiation and perpetuation of allergic inflammation by orchestrating the recruitment of eosinophil granulocytes to the tissue, where they might cause tissue damage and induce the symptoms of allergic inflammation. The biological effects of PGD2 are mediated by three distinct receptors, the DP receptor, chemoattractant receptor-homologous molecule expressed on Th2 cells (CRTH2), or at higher concentrations by the thromboxane receptor, TP. Small molecule antagonists of these receptors have recently become available and are currently being developed for the treatment of inflammatory diseases, such as bronchial asthma and eczema. However, the relative contributions of DP, CRTH2 and TP to PGD2-induced biological responses have still remained unclear, but the knowledge thereof is mandatory in order to predict which of these receptors are the most promising targets for the treatment of allergic disease and highlight their potential limitations. Eosinophil function will be investigated with respect to the release of eosinophils from the bone marrow, their recruitment into the tissue, the cells’ life span, and the release of pro-inflammatory mediators from eosinophils, such as reactive oxygen species, leukotrienes or exocytosed toxic granule contents. Moreover, we will test the potential clinical usefulness of CRTH2 and DP antagonists in vivo, using a murine model of ovalbumin-induced allergic pulmonary inflammation and airway hyperresponsiveness. Since the different biological responses to PGD2 can be mediated by CRTH2 or DP, respectively, a combined therapy with CRTH2 plus DP antagonists also needs to be given consideration. The study might hence lead to novel therapeutic regimens for the treatment of allergic inflammation and asthma.\r\n\r\n","en":"Prostaglandin (PG) D2 is released by mast cells during the allergic response. Others and our group have recently produced considerable evidence that PGD2 might be involved in the initiation and perpetuation of allergic inflammation by orchestrating the recruitment of eosinophil granulocytes to the tissue, where they might cause tissue damage and induce the symptoms of allergic inflammation. The biological effects of PGD2 are mediated by three distinct receptors, the DP receptor, chemoattractant receptor-homologous molecule expressed on Th2 cells (CRTH2), or at higher concentrations by the thromboxane receptor, TP. 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